Keskeinen ero kalsiumhypokloriitin ja natriumhypokloriitin välillä on, että kalsiumhypokloriitti sisältää kaksi hypokloriittianionia, jotka liittyvät yhteen kalsiumkationiin, kun taas natriumhypokloriitti sisältää yhden hypokloriittianionin, joka liittyy yhteen natriumkationiin. Ulkonäöltään kalsiumhypokloriitti on valkoisesta harmaaseen jauhe, kun taas natriumhypokloriitti on vihertävän keltainen kiinteä aine, jolla on makea haju.
Kalsium ja natriumhypokloriitti ovat ioniyhdisteitä, jotka sisältävät metallikationin ja klooriperäisen anionin. Näiden yhdisteiden anionien lukumäärä kationia kohden eroaa toisistaan metallikationin valenssin mukaan.
