Keskeinen ero DNA: n ja RNA-nukleotidin välillä on, että DNA-nukleotidi tai deoksiribonukleotidi sisältää deoksiriboosisokeria, kun taas RNA-nukleotidi tai ribonukleotidi sisältää riboosisokeria.
Nukleotidit ovat nukleiinihappojen perusyksikkö. Ne ovat DNA: n ja RNA: n rakennuspalikoita tai monomeerejä. Ne kytkeytyvät toisiinsa muodostaen polynukleotidiketjun, joka antaa rakenteen DNA: lle tai RNA: lle. Nukleotidissa on kolme pääkomponenttia. Ne ovat typpipohjainen, pentoosisokeri (viisi hiilensokeria) ja fosfaattiryhmät. On viisi erilaista typpipitoista emästä kuten adeniini, tymiini, sytosiini, guaniini ja Uracil. Tymiini näkyy vain DNA: ssa, kun taas urasiili on ainutlaatuinen RNA: lle. Nukleiinihapoissa on kahden tyyppisiä viittä hiilisokeria. RNA sisältää riboosisokeria, kun taas DNA sisältää deoksiriboosisokeria. Nukleotidit sisältävät kolme fosfaattiryhmää kiinnittyneenä pentoosisokeriin.