Keskeinen ero keinotekoisen alkion ystävyyskaupan ja somaattisten solujen ydinsiirron välillä on se, että keinotekoinen alkioiden ystävyyssuhde on tekniikka, jossa hedelmöitetty muna jakautuu kahteen geneettisesti identtiseen alkioon in vitro -olosuhteissa, kun taas somaattisten solujen ydinsiirto on tekniikka, johon somaattisen solun ydin enukleoituneeseen munasoluun tapahtuu in vitro -olosuhteissa.
Molekyylikloonaus on tärkeä tekniikka rekombinanttien organismien tuottamiseksi, joilla on parannetut merkit. Keinotekoinen alkioiden ystävyysklubi ja somaattisten solujen ydinsiirto ovat kahta tällaista tekniikkaa, joita käytetään in vitro -olosuhteissa kloonien luomiseksi sekä lisääntymis- että terapeuttisiin tarkoituksiin. Keinotekoisen alkion ystävyyskaupan ja somaattisten solujen ydinsiirron välillä on kuitenkin ero niiden kloonausmenetelmän suhteen.