Keskimääräinen ero mesenkymaalisten ja hematopoieettisten kantasolujen välillä on, että mesenkymaaliset kantasolut voivat erilaistua hermosoluiksi, luu-, rusto-, lihas- ja rasvakudossoluiksi, kun taas hematopoieettiset kantasolut voivat erilaistua kaikentyyppisiksi verisoluiksi kehossamme.
Kantasolut ovat erottamattomia tai spesialisoitumattomia soluja, joita on kehossamme. Ne pystyvät jakamaan ja antamaan saman tyyppisiä kantasoluja tai erilaistumaan erikoistuneiksi soluiksi kudoksissa, joilla on määritellyt toiminnot. Näiden kantasolujen merkittävien kykyjen ansiosta niitä käytetään vaurioituneiden kudosten korjaamiseen ja uudistamiseen. Mesenkymaaliset kantasolut ja hematopoieettiset kantasolut ovat kahden tyyppisiä kantasoluja, jotka ovat erittäin tärkeitä. Mesenkymaaliset kantasolut (ei-hematopoieettiset kantasolut) ovat multipotentteja kantasoluja, jotka voivat tuottaa luu-, rusto- ja rasvasoluja. Toisaalta hematopoieettiset kantasolut voivat muodostaa kaikenlaisia verisoluja kehossa. Lisäksi molempia näitä kantasolutyyppejä esiintyy luuytimessä.