Tärkein ero endosytoosin ja eksosytoosin välillä on, että endosytoosi tuo aineita soluun, kun taas eksosytoosi kuljettaa aineita solun ulkopuolelle.
Solussa on solukalvo, joka toimii estona solun sisäosan ja ulkoisen ympäristön välillä. Siksi solut tarvitsevat jonkinlaisen kuljetusmekanismin, jotta niillä olisi tällainen kalvo, jotta ne voivat muodostaa yhteyden ulkoiseen ympäristöön. Esimerkiksi solujen on hankittava ravinteita ja eritettävä jäte solusta. Tätä tarkoitusta varten soluilla on neljä perussiirtomekanismia: diffuusio, osmoosi, aktiivinen kuljetus ja irtotavarakuljetus. Diffuusio ja osmoosi ovat passiivisia prosesseja, kun taas aktiivinen kuljetus ja irtotavarakuljetukset ovat aktiivisia prosesseja, jotka kuluttavat energiaa. Endosytoosi ja eksosytoosi ovat kahden tyyppisiä irtotavarakuljetusmekanismeja, jotka kuljettavat isoja hiukkasia plasmakalvon läpi joko solusta ulkoiseen ympäristöön tai ulkoisesta ympäristöstä soluun. Molemmat mekanismit muodostavat kalvoon sitoutuneet rakkulat kuljetusvälineenä.
