Tärkein ero - DNA ylävirtaan verrattuna alavirtaan
On tärkeää, että sinulla on yleistä tietoa DNA: n koostumuksesta ja rakenteesta, jotta ymmärretään ero DNA: n ylävirran ja alavirran välillä. DNA koostuu polynukleotidiketjuista. Nukleotidit ovat rakennuspalikoita, jotka luovat polynukleotidiketjuja, ja kukin nukleotidi on valmistettu kolmesta komponentista: viiden hiilen sokerista, typpipitoisesta emäksestä ja fosfaattiryhmästä. Fosfaattiryhmä ja OH-ryhmä ovat kiinnittyneet sokerimolekyylin 5'-asemahiileen ja 3'-asemahiileen nukleotidissa. Nukleotidit liitetään toisiinsa fosfodiesterisidoksilla, jotka muodostuvat yhden nukleotidin 5'-fosfaattiryhmän ja viereisen nukleotidin 3'-OH-ryhmän väliin. Jos polynukleotidiketjussa on vapaa 5'-fosfaattiryhmä, se on osoitettu 5'-pääksi; jos sillä on vapaa 3'-OH-ryhmä, se määritetään 3'-pääksi. Siksi,DNA-säikeillä on yleensä 5'- ja 3'-päät polynukleotidiketjujen pääteasemien mukaan. DNA esiintyy myös kaksijuosteisena muotona. Kaksi säikettä ovat vastakkaisia toistensa kanssa. Siksi DNA: lla on kaksi säiettä, jotka kulkevat kohti suuntaan 5 '- 3' ja suuntaan 3 '- 5'. Ylävirran ja alavirran DNA: han viitataan 5 '- 3' mRNA-juosteen transkriptioon ja synteesiin viitaten. Jos DNA: ta pidetään koodaavan juosteen 5 päätä kohti transkription aloituskohdasta, se tunnetaan ylävirran DNA: na. Jos DNA: ta pidetään kohti 3'-päätä koodaavasta juosteesta transkription aloituskohdasta, kutsutaan alavirran DNA: ksi. Tämä on keskeinen ero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä. Kaksi säikettä ovat vastakkaisia toistensa kanssa. Siksi DNA: lla on kaksi säiettä, jotka kulkevat suuntaan 5 '- 3' ja 3 '- 5'. Ylävirran ja alavirran DNA: han viitataan 5 '- 3' mRNA-juosteen transkriptioon ja synteesiin viitaten. Jos DNA: ta pidetään koodaavan juosteen 5 päätä kohti transkription aloituskohdasta, se tunnetaan ylävirran DNA: na. Jos DNA: ta pidetään kohti 3'-päätä koodaavasta juosteesta transkription aloituskohdasta, kutsutaan alavirran DNA: ksi. Tämä on avainero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä. Kaksi säikettä ovat vastakkaisia toistensa kanssa. Siksi DNA: lla on kaksi säikettä, jotka kulkevat kohti suuntaan 5 '- 3' ja suuntaan 3 '- 5'. Ylävirran ja alavirran DNA: han viitataan 5 '- 3' mRNA-juosteen transkriptioon ja synteesiin viitaten. Jos DNA: ta pidetään koodaavan juosteen 5 päätä kohti transkription aloituskohdasta, se tunnetaan ylävirran DNA: na. Jos DNA: ta pidetään kohti 3'-päätä koodaavasta juosteesta transkription aloituskohdasta, kutsutaan alavirran DNA: ksi. Tämä on avainero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä. Jos DNA: ta pidetään koodaavan juosteen 5 päätä kohti transkription aloituskohdasta, se tunnetaan ylävirran DNA: na. Jos DNA: ta pidetään kohti 3'-päätä koodaavasta juosteesta transkription aloituskohdasta, kutsutaan alavirran DNA: ksi. Tämä on keskeinen ero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä. Jos DNA: ta pidetään koodaavan juosteen 5 päätä kohti transkription aloituskohdasta, se tunnetaan ylävirran DNA: na. Jos DNA: ta pidetään kohti 3'-päätä koodaavasta juosteesta transkription aloituskohdasta, kutsutaan alavirran DNA: ksi. Tämä on keskeinen ero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on ylävirran DNA
3. Mikä on alavirran DNA
4. Vertailu rinnakkain - ylävirtaan verrattuna alavirtaan DNA
5. Yhteenveto
Mikä on ylävirran DNA?
Geeni on rakenteellinen ja toiminnallinen yksikköperinnöllisyys, joka sijaitsee organismin DNA: lla. Se varastoidaan ohjeiden avulla proteiinin muodostamiseksi. Geenillä on DNA-molekyylin spesifinen alue. Tarvittaessa se transkriptoituu ja muuttuu proteiiniksi synteesin avulla mRNA-juosetta. Normaalisti geenin koodaava juoste kulkee 5'-3'-suuntaan. Kun se on transkriptoitu, se tuottaa mRNA-juosteen samaan suuntaan 5 '- 3'. Transkription aikana 3'-5'-antisense-juosetta tarjotaan templaattisäikeenä ja se aloittaa mRNA-synteesin. Geenissä on transkription aloituskohta. Viitaten transkription aloituskohtaan koodaavan juosteen 5'-päätä kohti oleva DNA-alue tunnetaan ylävirran DNA: na. Geenin promoottori sijaitsee normaalisti DNA: n ylävirran alueella. Eukaryoottisissa geeneissägeenin ylävirran alueella on TATA-laatikoita, promoottorin proksimaalisia elementtejä ja tehostajia. Geenin ylävirran alueelle viitataan negatiivisilla numeroilla. Geenin ylävirran DNA: lla on erittäin tärkeä merkitys transkriptiolle.
Mikä on alavirran DNA?
Transkription aloituskohta tunnetaan geenin +1 pisteenä. DNA-alue +1 pisteestä kohti koodaavan juosteen 3'-päätä tunnetaan alavirran DNA: na. Toisin sanoen geenin alavirta on transkription aloituskohdasta kohti templaattisäikeen 5'-päätä. Siksi geenialueen alavirran DNA sisältää transkriptioyksikön ja muut sekvenssit, kuten terminaattorisekvenssin. Promoottori voi vaikuttaa geenin alavirran sekvenssiin. Geenin alavirran osaan viitataan positiivisilla numeroilla. Geenin alavirran DNA on todellinen alue, joka antaa proteiinituotteen.
Kuva 01: Ylävirran ja alavirran DNA
Mitä eroa on ylävirran ja alavirran DNA: n välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Ylävirtaan vs. alavirran DNA |
|
| DNA-alue koodaavan sekvenssin 5'-päätä kohti transkription aloituskohdasta tunnetaan ylävirran DNA: na. | DNA-alue koodaavan juosteen 3'-päätä kohti transkription aloituskohdasta tunnetaan alavirran DNA: na. |
| Elementit | |
| Promoottorit ja tehostajat sijaitsevat ylävirran DNA: ssa | Transkriptioyksikkö ja terminaattorisekvenssit sijaitsevat alavirran DNA: ssa. |
| Numerointi | |
| Ylävirran alueen nukleotideihin viitataan negatiivisilla numeroilla | Nukleotideihin viitataan positiivisilla numeroilla. |
| Toiminto | |
| Tämä alue sisältää elementtejä, jotka ovat välttämättömiä transkription säätelemiseksi ja aloittamiseksi | Tämä alue sisältää käskyn tuottaa proteiinia ja lopettaa transkriptio |
Yhteenveto - ylävirta vs alavirran DNA
RNA-juosteesta on helppo tunnistaa ylävirtaan ja alavirtaan. Vertailukohteen osalta alue RNA-juosteen 5'-päätä kohti tunnetaan ylävirran RNA: na, kun taas alue 3'-päätä kohti tunnetaan alavirran RNA: na. DNA: ssa on kuitenkin kaksi säikettä, jotka kulkevat molempiin suuntiin 5 '- 3' ja 3 '- 5'. Siksi ero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä on monimutkainen. Siksi se erilaistuu viittaamalla geenin transkriptioon. Transkription aloituskohdasta sense-juosteen 5 päätä kohti DNA-alue tunnetaan ylävirran DNA: na, kun taas transkription aloituskohdasta sense-juosteen 3'-päätä kohti tunnetaan alavirran DNA: na. Tämä on ero DNA: n ylävirran ja alavirran välillä.
