Tärkein ero fagosytoosin ja opsonisaation välillä on se, että fagosytoosi on mekanismi, jonka tietyt solut tai organismit toteuttavat vieraiden hiukkasten nielemiseen tai nielemiseen, kun taas opsonisaatio on prosessi, jolla patogeenit poistetaan järjestelmästä, kun ne on merkitty opsoniinien avulla.
Immunologiset vasteet voivat olla synnynnäisiä tai mukautuvia. Taudinaiheuttajilla on patogeenitunnistusreseptoreita, jotka helpottavat isännän tunnistamista. Opsonisointi ja fagosytoosi ovat kaksi immunologista vastetta. Opsonisaatiossa isäntä tunnistaa ja merkitsee tunkeutuneet hiukkaset hävitettäväksi opsoniinien tuotannolla. Fagosytoosi on mekanismi, jolla tietyt immuunisolut imevät ja tuhoavat kehoon tunkeutuvia tai vieraita hiukkasia.
