Keskeinen ero homologisten ja homeologisten kromosomien välillä on, että homologiset kromosomit ovat kromosomeja, joilla on yhteinen syntyperä, kun taas homeologiset kromosomit ovat kromosomeja, joilla on epäselvä luonne ja jotka ovat osittain homologisia.
Kromosomit ovat rakenteellisia komponentteja, jotka kuljettavat organismin geneettistä tietoa. Eukaryoottien ydinmateriaali on järjestetty muodostamaan kromosomeja, jotka ovat nukleiinihappojen ja proteiinien kompakteja rakenteita. Lisäksi on olemassa erityyppisiä kromosomeja sen perusteella, miten ne käyvät läpi solujen jakautumisen. Homologiset ja homeologiset kromosomit ovat kahden tyyppisiä kromosomeja, joilla on tärkeä rooli genetiikan alalla.