Tärkein ero mikrofagin ja makrofagin välillä on se, että mikrofagi on eräänlainen pieni fagosyytti, joka elää vain muutaman päivän, kun taas makrofagi on eräänlainen suurempi fagosyytti, jolla on pidempi käyttöikä.
Immuunijärjestelmämme taistelee hyökkäävien patogeenisten mikro-organismien kanssa ja pitää meidät turvassa. Siksi se on monimutkainen järjestelmä, joka toteuttaa monia erilaisia puolustusmekanismeja hyökkääjien havaitsemiseksi ja tuhoamiseksi. Fagosytoosi on yksi mekanismi, jossa fagosyytit nielevät tunkeutuvat hiukkaset ja tappavat ne. Fagosyytit ovat soluja, jotka kykenevät imemään ja imemään bakteereja, ja muut vieraat solut ja tarttuvat hiukkaset tuhoavat niissä. Vastaavasti fagosyyttejä on kahta päätyyppiä, nimittäin mikrofagi ja makrofagi. Mikrofagi on pieni polymorfonukleaarinen fagosyytti, jota esiintyy paljon. Toisaalta makrofagi on eräänlainen fagosyytti, joka sijaitsee useissa tärkeissä paikoissa kehossamme toimiakseen etulinjan puolustusmekanismina hyökkääviä hiukkasia vastaan. Ne ovat suuria syöjiä immuunijärjestelmässämme.
