Tärkein ero - bakteerien transposaasit vs. retroviruslääkkeet
Siirrettävä geneettinen materiaali on kehittynyt kahdella päästrategialla siirtyäksesi alueelta seuraavalle alueelle genomien sisällä ja välillä. Yksi menetelmä on syrjäyttää RNA-molekyyli läpi ennen DNA-molekyylin muodostumista, kun taas toinen reitti sisältää DNA-välituotteita. Transposaasit ja viruksen integraatit ovat esimerkkejä tällaisesta siirrettävästä geneettisestä materiaalista. Bakteeritransposaasit sitoutuvat transposonien päähän ja helpottavat transposoniliikkeen katalysoitumista toiseen genomin osaan erilaisten mekanismien avulla. Retroviruksen integraasit ovat entsyymejä, jotka auttavat retroviruksen, kuten HIV, geneettisen materiaalin integroitumisessa sen tartuttaman isäntäsolun geneettiseen materiaaliin (DNA). Tämä on keskeinen ero bakteeritransposaasien ja retrovirusvirusten välillä.
SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mitä ovat bakteerien transposaatiot
3. Mitä ovat retrovirusintegraasit
4. Bakteeritransposaasien ja retrovirusintegraasien väliset yhtäläisyydet
5. Vertailu vierekkäin - bakteeritransposaasit vs. retroviruslääkkeet taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Mitä bakteerien transposaasit ovat?
Transposaasi voidaan määritellä entsyymiksi, joka on sitoutunut transposonien päähän, mikä helpottaa transposonin liikkumisen katalysointia genomin toiseen osaan erilaisten mekanismien avulla. Tällaisia mekanismeja ovat '' leikkaa ja liitä '' ja '' replikatiivinen siirtomekanismi ''. Transposaasi lisättiin ensin kloonaamalla entsyymi, jota tarvitaan Tn3-transposonin siirtämiseen. Transponoitavat geneettiset elementit ovat käyttäneet kahta tärkeää strategiaa siirtymässä genomien välillä tai paikasta toiseen. Kuljetus RNA: n välituotteen läpi ennen DNA-kopion synteesiä on yksi strategia, kun taas toinen on sitoutunut yksinomaan DNA: n välituotteisiin. Rekombinaatioreaktiot, jotka ovat mukana molempien alkuaineiden integroinnissa, tapahtuvat elementtispesifisten entsyymien ansiosta. Täten,DNA-alkuaineina nämä entsyymit tunnetaan transposaaseina, kun taas RNA-alkuaineina ne tunnetaan integraaseina.
Verrattaessa molempien transponointistrategioiden välisiä eroja insertioprosessi näyttää olevan identtinen kemiallisesti. Mutta tuoreet todisteet viittaavat siihen, että integraatiomekanismin tietyt samankaltaisuudet nähdään aktiivisen kohdan muodostavien aminohapposekvenssien alueilla; DDE-motiivi. Viisi transposaasiperhettä luokitellaan tällä hetkellä, mutta perheiden lukumäärä on vielä kasvamassa uusien transposaasimerkkien kanssa. Perheisiin kuuluvat DDE-transposaasi, tirosiini (Y) -transposaasi, seriini (S) -transposaasi, Rolling Circle -transposaasi, käänteistranskriptaasit / endonukleaasit (RT / En) jne. Nämä perheet käyttävät ainutlaatuisia katalyyttisiä mekanismeja DNA: n hajoamiseen ja liittymiseen uudelleen. DDE-transposaasi sisältää alkuperäisen transposonin leikkaus- ja liittämismekanismin ja sisältää kolme konservoituneiden aminohapposarjaa, nimittäin;aspartaatti (D), aspartaatti (D) ja glutamaatti (E). Tyrosiinitransposaasit osallistuvat myös leikkaus- ja liimamekanismiin käyttämällä tyrosiinitähdettä, joka on paikkaspesifinen.
Kuva 01: Bakteerien transposaasit
Seriinitransposaasit sisältävät pyöreän DNA: n välituotteen ja suorittavat leikkaus- ja liittämismekanismin aivan kuten yllä olevat perheet. Liikkuvan ympyrän transposaasi liittyy kopiointimekanismiin, jossa yksi juoste kopioidaan suoraan kohdekohtaan DNA-replikaation kautta. Tämä varmistaa, että templaattisäikeellä ja kopioidulla säikeellä on äskettäin syntetisoitu juoste. Käänteistranskriptaasien / endonukleaasien transposaasilla on useita mekanismeja transponointiin.
Mitä ovat retroviruslääkkeet?
Retroviruksen integraasin yhteydessä sitä pidetään retrovirusentsyyminä, joka auttaa retroviruksen, kuten HIV, geneettisen materiaalin integroitumisessa infektoituneen solun geneettiseen materiaaliin (DNA). Nämä retroviruksen kokonaisluvut sekoittuvat useimmiten faagi-integraaseihin. Esimerkkejä faagi-integraaseista ovat λ-faagi-integraasi. Mutta nämä ovat täysin erilaisia entsyymejä, eikä niitä pitäisi sekoittaa. Mitä tulee retroviruksen esieintegraatiokompleksin muodostumiseen, retroviruksen integraasilla on tärkeä rooli. Retroviruksen integraasiproteiinit koostuvat tyypillisesti kolmesta (03) kanonisesta domeenista. Nämä verkkotunnukset on kytketty joustavilla linkkerillä.
Kolme domeenia sisältävät N-terminaalisen sinkkiä sitovan domeenin, jossa kolme kierteistä nippua on kytketty ja vakiintunut koordinoimalla Zn 2+: n kanssa.kationin, RNaasi H -kertaisen katalyyttisen ydiodomeenin ja C-terminaalisen DNA: ta sitovan domeenin, joka on SH3-kertainen. Tutkimuksella sekä biokemiallisten ja rakenteellisten tietojen avulla se viittaa siihen, että retrovirusvirta-integraasilla on kyky toimia himmentimien dimeerinä (tetrameeri). Multimerisaation ja virus-DNA: n sitoutumisen yhteydessä retroviruksen integraasiproteiinin kaikki kolme domeenia. Retroviruksen integraasin tärkein tehtävä on lisätä sen geneettinen materiaali isännän DNA: han. Tämä vaihe on tärkein vaihe HIV-viruksen replikaatiossa. Kun se on onnistuneesti integroitu, se on siellä solun kromosomaalisessa DNA: ssa loppuelämänsä ajan.
Kuva 02: Retroviruslääkkeet
Siksi, kun se on integroitu, solulle ei ole paluuta. Nämä retroviruksen integraalit sisältävät kahden pääreaktion katalysoinnin, mukaan lukien 3'-pään käsittely ja kovalenttinen ligaatio. 3'-loppuprosessoinnin aikana 2-3 nukleotidia virus-DNA: n molemmista 3'-päistä poistetaan tarkoituksena paljastaa virus-DNA: n 3'-päiden CA-dinukleotidit, ja kovalenttisen ligaation aikana prosessoidut 3'-päät virus-DNA ligoidaan kovalenttisesti isäntäkromosomaaliseen DNA: han.
Mikä on bakteeritransposaasien ja retroviruksen integraasien välinen samankaltaisuus?
Sekä bakteerien transposaaseilla että retrovirusten integraaseilla on samanlaiset aminohapposekvenssit
Mikä on ero bakteeritransposaasien ja retrovirusintegraasien välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Bakteerien transposaasit vs. retroviruslääkkeet |
|
| Bakteeritransposaasi on entsyymi, joka on sitoutunut transposonien päähän, samalla kun se helpottaa transposoniliikkeen katalysoitumista toiseen genomin osaan erilaisten mekanismien avulla. | Retroviruslääkkeitä pidetään retrovirusentsyyminä, joka auttaa integroimaan retroviruksen, kuten HIV, geneettisen materiaalin tartunnan saaneen solun geneettiseen materiaaliin (DNA). |
| Sitovat alueet | |
| Bakteerien transposaatioihin tarvitaan erittäin spesifisiä sitoutumisalueita. | Sitoutumiseen tarvitaan vähemmän tai ei ollenkaan nukleotidisekvenssiä. |
Yhteenveto - Bakteerien transposaasit vs. retroviruslääkkeet
Bakteeritransposaaseja pidetään retrovirusentsyyminä, joka auttaa retroviruksen, kuten HIV, geneettisen materiaalin integroitumisessa infektoituneen solun geneettiseen materiaaliin (DNA). Transponoitavat geneettiset elementit ovat käyttäneet kahta tärkeää strategiaa siirtymässä genomien välillä tai paikasta toiseen. Viisi transposaasiperhettä luokitellaan tällä hetkellä, mutta perheiden lukumäärä on vielä kasvamassa uusien transposaasimerkkien kanssa. Retroviruksen integraasia, sitä pidetään retroviruksen entsyyminä, joka auttaa retroviruksen, kuten HIV, geneettisen materiaalin integroitumisessa tartunnan saaneen solun geneettiseen materiaaliin (DNA). Retroviruksen integraasiproteiinit koostuvat tyypillisesti kolmesta (03) kanonisesta domeenista. Retroviruksen integraasin tärkein tehtävä on lisätä sen geneettinen materiaali isännän DNA: han. Tämä vaihe on tärkein vaihe HIV-viruksen replikaatiossa. Siksi soluun ei ole paluuta, kun se on integroitu. Tämä on ero bakteeritransposaasien ja retroviruksen integraasin välillä.
Lataa PDF-tiedosto bakteerien transposaatioista vs retrovirusten integraaseista
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainausviestin mukaan. Lataa PDF-versio täältä: Ero bakteeritransposaasien ja retrovirusintegraasien välillä
