Tärkein ero loisen ja bakteerien välillä on, että bakteerit ovat yksisoluisia mikroskooppisia prokaryooteja, jotka elävät kaikkialla, kun taas loiset ovat organismeja, jotka elävät isäntässään tai isäntässään aiheuttaen samalla isäntien infektioita.
Parasiitit ja bakteerit ovat organismeja, jotka muistuttavat hyvin alkeellisia organismeja, mutta joilla on hyvät mukautumiset selviytyä erilaisissa ympäristöolosuhteissa. Ihmisille nämä organismit ovat ensiarvoisen tärkeitä, koska suurin osa ihmisen infektioista johtuu niistä. Joskus tiettyjä bakteereja pidetään loisina.