Tärkein ero - YAC vs M13 Phage Vector
DNA-kloonaus on tärkeä prosessi, joka mahdollistaa tärkeiden organismien DNA-fragmenttien etenemisen. Se vaatii spesifisen DNA: n liittämistä vektori-DNA: han rekombinantti-DNA: n luomiseksi, joka muuttuu isäntäorganismiksi. Vektori on DNA-molekyyli, joka käyttäytyy kantajana kuljettaakseen vierasta geenimateriaalia toiseen soluun tai organismiin. Sen pitäisi pystyä replikoitumaan isäntäorganismin sisällä ja tuottamaan useita kopioita rekombinantti-DNA: sta. DNA-kloonauksessa käytetään erilaisia vektoreita. Hiivan keinotekoinen kromosomi (YAC) ja M13-faagivektori ovat kahdenlaisia. Keskeinen ero YAC- ja M13-faagivektorien välillä on, että YAC on keinotekoinen kromosomi, joka replikoituu hiivasoluissa, kun taas M13-faagivektori on bakteerifagin M13 yksijuosteinen pyöreä DNA, joka replikoituu E Coli -soluissa.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on YAC
3. Mikä on M13-faagivektori
4. Vertailu vierekkäin - YAC vs. M13-faagivektori
5. Yhteenveto
Mikä on YAC-vektori?
YAC on keinotekoisesti rakennettu kromosomi, jolla on kyky kuljettaa suuri osa vierasta vierasta DNA: ta ja replikoitua hiivasoluissa. Siinä on sentromeeria, telomeeriä ja itsenäisesti replikoituvia sekvenssejä, jotka ovat välttämättömiä replikaation ja stabiilisuuden kannalta. YAC: ssä tulisi myös olla selektiivinen markkeri tai markkereita ja restriktiokohtia, jotta siitä tulisi tehokas kloonausvektori. Suuret sekvenssit, jotka vaihtelevat välillä 1000 kb - 2 000 kb, voidaan lisätä YAC: iin ja siirtää hiivaan.
Kuva 01: YAC-vektori
Mikä on M13 Phage Vector?
Bacteriophage M13 on virus, joka tartuttaa ja replikoituu E-kolissa. M13-bakteriofagin genomi on kooltaan pieni, noin 6,7 kt. Se on yksijuosteinen, pyöreä ja positiivinen sense-DNA. Tämä virus tartuttaa erityisesti E Coli -bakteerit F piluksen kautta. Kun se tulee ssDNA: n bakteeriin, se syntetisoi sen komplementaarisen juosteen ja siitä tulee dsDNA tai M13: n replikatiivinen muoto (RF). RF voi käyttäytyä plasmidin tavoin isäntäorganismissa. DsDNA replikoituu E Colissa ja tuottaa ssDNA: ta, joka sisältää uusia faageja. Nämä uudet faagit vapautuvat jatkuvasti E-kolista tappamatta isäntäsolua. Infektio kuitenkin hidastaa E Colin kasvua. dsDNA voidaan uuttaa bakteerisoluista ja käyttää vektorina DNA-kloonauksessa. Ne tunnetaan M13-faagivektoreina. Niitä voidaan helposti manipuloida ja käyttää samalla tavalla kuin plasmidivektoreita.
Näiden M13-faagien infektion luontainen kyky toimii hyvänä pätevyytenä käytettäväksi vektorina geenikloonauksessa. Kun kehitetään M13 vektoriksi, sen genomiin tulisi sisällyttää useita elementtejä. Ne ovat geeni lac-repressori (lac I) -proteiinille, lac Z-geenin operaattori-proksimaalinen alue, lac-promoottori ja moninkertainen kloonauskohde (polylinker). Kun M13: n dsDNA: ta käytetään vektoreina, sitä voidaan käsitellä plasmidivektorina. SsDNA M13: n käytöllä on kuitenkin etuja DNA-sekvensoinnissa ja kohdennetussa mutageneesissä.
Koska M13-faagivektorilla on useita kloonauspaikkoja lacZ-alueella, yhdistetyt vektorit voidaan helposti tunnistaa sini- / valkoisen pesäkkeen seulonnalla agarlevyillä, jotka sisältävät IPTG: tä ja X-Gal: ta. Levyillä tuotetut siniset plakit eivät sisällä rekombinoituja faageja. Siksi faagit, joissa on inserttejä, voidaan valita kloonaustarkoitusta varten.
Kuva 02: Bakteriofaagi M13
Mitä eroa on YAC: n ja M13 Phage Vectorin välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
YAC vs M13 Phage Vector |
|
| YAC on geneettisesti muunnettu kromosomi, jolla on kyky kuljettaa suuri osa vierasta DNA: ta ja replikoitua hiivasoluissa. | M13-faagivektori on bakteerifagi M13: n kehittämä virusvektori, jota käytetään vieraan DNA: n lisäämiseen E-koliin. |
| Tarkoitus | |
| YAC: t suunniteltiin kloonaamaan suuret fragmentit genomisesta DNA: sta hiivaan. | M13-faagivektoreita käytetään vieraan DNA: n lisäämiseen E Coli: een. |
| Lisää pituus | |
| YAC: t voivat sisältää megabaasikokoisia genomisia inserttejä (1000 kb - 2000 kb). | Terien koko on noin 1500 bps. |
| Rakentaminen | |
| YAC-DNA: ta on vaikea puhdistaa ehjänä ja se vaatii suurta konsentraatiota YAC-vektorijärjestelmän muodostamiseksi. | Se tapahtuu syklisen fotosynteettisen elektroniketjun kautta. |
| Vakaus | |
| YAC on epävakaa. | M13-faagit voidaan helposti uuttaa. |
| Koko | |
| Entsyymit ovat suurempia molekyylejä. | M13-faagit ovat stabiileja kuin YAC. |
Yhteenveto - YAC vs M13 Phage Vector
YAC on keinotekoisesti rakennettu vektorijärjestelmä, joka käyttää hiivakromosomin tiettyä aluetta suurten geneettisen materiaalin segmenttien lisäämiseksi hiivasoluihin. M13-faagivektori on vektorijärjestelmä, joka on johdettu bakteriofaagista M13 ja joka käyttää E colia isäntänä. Tämä on tärkein ero YAC: n ja M13 Phage Vectorin välillä. Molemmat ovat yhtä hyödyllisiä rekombinantti-DNA-tekniikassa ja geenikloonauksessa.
