Tärkein ero Harrisin ja Mayerin hematoksyliinin välillä on se, että Harriksen hematoksyliinia käytetään regressiivisessä värjäyksessä, kun taas Mayerin hematoksyliinia käytetään progressiivisessa värjäyksessä.
Hematoksyliini on emäksinen väriaine, jota käytetään yleisesti histopatologiassa. Se on Haematoxylon campechianum -puusta uutettu luonnollinen väriaine. Se on tummansininen tai violetti väriaine. Hematoksyliini mahdollistaa solu- ja kudososien mikroskooppisten ydinosien esittelyn. Tämä väriaine on positiivisesti varautunut, joten se sitoutuu negatiivisesti varautuneisiin aineisiin, kuten DNA: han ja RNA: han, ja värjää ne violettiin väriin. Hematoksyliini vaatii peittoa, joka auttaa muodostamaan yhteyden kudososiin. Mordantti on kemikaali, erityisesti alumiinin, raudan, volframin suola, joka helpottaa väriaineen kytkemistä kudoskomponenttiin.
Niiden sisältämien peitteiden perusteella on saatavana useita hematoksyliinityyppejä. Jotkut niistä ovat Ehrlichin, Mayerin, Harrisin, Gillin, Delafieldin, Colen ja Carazzin hematoksyliinit. Sekä Harrisin että Mayerin hemoksyliinivalmisteet ovat alumiinipohjaisia peittäviä hematoksyliinejä.
