Keskeinen ero solunsisäisen ja solujenvälisen signaloinnin välillä on, että solunsisäinen signalointi on viestintä solun sisällä, kun taas solujen välinen signalointi on solujen välinen viestintä.
Solut vapauttavat signalointimolekyylit kohdesoluihin ja kommunikoivat keskenään signalointimolekyylien kautta monisoluisissa organismeissa. Kohdesoluilla on reseptoreita solupinnoillaan ja sytoplasmassa vastaanottamaan signaaleja ja toimimaan sen mukaisesti. Lisäksi solun sisällä tapahtuu viestintää organellien ja ytimen välillä solutoimintojen suorittamiseksi. Siksi on olemassa kahden tyyppinen soluyhteys: solunsisäinen signalointi tai viestintä ja solujen välinen viestintä tai signalointi.