Tärkein ero mikrotubulusten ja mikrofilamenttien välillä on se, että tubuliini on mikrotubuluksia tuottava proteiini, kun taas aktiinin mikrofilamentteja tuottava proteiini. Mikrotubulukset ovat myös pitkiä onttoja putkimaisia rakenteita, kun taas mikrofilamentit ovat pallomaisen proteiiniaktiinin lineaarisia polymeerejä.
Proteiinikuidut ovat välttämättömiä elävien solujen monien toimintojen suorittamiseksi. Mikrotubulukset ja mikrofilamentit ovat kahden tyyppisiä kuituja, joita esiintyy jokaisen eukaryoottisen solun sytoplasmassa. Nämä kuidut ovat pohjimmiltaan vastuussa risteytysverkkojen tekemisestä sytoplasman 'sytoskeletona'. Sytoskeletti on dynaaminen järjestelmä, joka auttaa ylläpitämään solun muotoa ja ankkuroimaan solun organellit sytoplasmassa. Edellä mainittujen kahden tyyppisten kuitujen lisäksi myös välikuidut ovat tärkeitä sytoskeletin valmistuksessa. Tietyt kuidut muodostavat myös liikkumisrakenteita (flagella, ripset jne.), Joita tavallisesti esiintyy tietyissä prokaryooteissa.