Sisällysluettelo:
- Tärkein ero - Nick Translation vs Primer Extension
- Mikä on Nick Translation?
- Mikä on Primer Extension?
- Mitä eroa on Nick Translationin ja Primer Extensionin välillä?
- Yhteenveto - Nick Translation vs Primer Extension
Video: Ero Nick Translationin Ja Primer Extensionin Välillä
2024 Kirjoittaja: Mildred Bawerman | [email protected]. Viimeksi muokattu: 2023-12-16 08:38
Tärkein ero - Nick Translation vs Primer Extension
Nick-käännös ja alukkeen jatkaminen ovat kaksi tärkeää tekniikkaa, joka suoritetaan molekyylibiologiassa. Keskeinen ero nick-translaation ja alukkeen pidennyksen välillä on se, että nick-translaatioprosessi tuottaa leimattuja koettimia muille hybridisaatiotekniikoille, kun taas alukkeen jatkamismenetelmä tunnistaa spesifisen RNA-sekvenssin seoksesta ja paljastaa tietoa mRNA: n ilmentymisestä. Molemmilla tekniikoilla on suuri merkitys ja ne suoritetaan rutiininomaisesti molekyylitutkimuslaboratorioissa.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on Nick Translation
3. Mikä on Primer Extension
4. Vertailu rinnakkain - Nick Translation vs Primer Extension
5. Yhteenveto
Mikä on Nick Translation?
Nick-translaatio on tärkeä tekniikka, jota käytetään leimattujen koettimien valmistamiseen erilaisille molekyylibiologisille tekniikoille, kuten blottaus, in situ -hybridisaatio, fluoresoiva in situ -hybridisaatio jne. Se on in vitro -menetelmä DNA-leimaamiseksi. DNA-koettimia käytetään spesifisten DNA- tai RNA-sekvenssien tunnistamiseen. Leimatun koettimen avulla spesifiset fragmentit voidaan merkitä tai visualisoida kompleksisesta nukleiinihapposeoksesta. Siksi leimatut koettimet valmistetaan käyttämällä erilaisia tekniikoita, joita käytetään eri tekniikoihin. Nick-käännös on yksi sellainen menetelmä, joka tuottaa leimattuja koettimia DNaasi 1- ja DNA-polymeraasi 1 -entsyymien avulla.
Lempinimen käännösprosessi alkaa DNaasi 1 -entsyymiaktiivisuudella. DNaasi 1 tuo nikkelit kaksijuosteisen DNA: n fosfaattirunkoon katkaisemalla fosfodiesterisidokset nukleotidien välillä. Kun lempinimi on luotu, saadaan nukleotidin vapaa 3'-OH-ryhmä ja DNA-polymeraasi 1 -entsyymi vaikuttaa siihen. DNA-polymeraasi 1: n 5'-3'-eksonukleaasiaktiivisuus poistaa nukleotidit nikkelistä kohti DNA-juosteen 3'-suuntaa. Samanaikaisesti DNA-polymeraasi 1 -entsyymin polymeraasiaktiivisuus toimii ja lisää nukleotideja korvaamaan poistetut nukleotidit. Jos nukleotidit leimattiin, korvautuminen tapahtuu leimattuilla nukleotideilla ja se merkitsee DNA: n tunnistamista varten. Tätä vasta syntetisoitua leimattua DNA: ta voidaan käyttää koettimina erilaisissa hybridisaatioreaktioissa molekyylibiologiassa.
Kuva 01: Nickin käännösprosessi
Mikä on Primer Extension?
Alukepidennys on tekniikka, jota käytetään spesifisen RNA-sekvenssin löytämiseen RNA-seoksesta ja mRNA-transkriptin 5'-pään paikantamiseen. Sitä käytetään myös RNA: n rakenteen ja ilmentymisen tutkimiseen. Alustepidennysmenetelmä suoritetaan leimattujen alukkeiden tai leimattujen nukleotidien kanssa. Jos käytetään leimattuja alukkeita, se sulkee pois tarpeen leimata nukleotidit, joita käytetään cDNA: n synteesissä. Tässä tekniikassa on useita vaiheita. Se alkaa RNA: n uuttamisesta näytteestä. Sitten seokseen lisätään leimattu oligonukleotidialuke yhdessä tarvittavien aineosien kanssa tietyn RNA-sekvenssin cDNA: n syntetisoimiseksi. Primer hehkuttaa seoksen komplementaarisen sekvenssin kanssa. Käyttämällä alukkeella hehkutettua sekvenssiä mallina,entsyymi käänteistranskriptaasi syntetisoi RNA-sekvenssin komplementaarisen DNA: n (cDNA). Alukkeen hehkutus ja käänteiskopiointi tapahtuvat vain, kun näytteessä on spesifistä RNA-sekvenssiä. Lopuksi, kun suoritetaan denaturointigeelielektroforeesi, RNA-sekvenssin koko voidaan määrittää. On myös helppo löytää mRNA (transkription aloituskohta) -sekvenssin +1 emäs alukepidennysmenetelmällä. Näytteessä olevan mRNA: n määrä voidaan kvantifioida tällä menetelmällä, jos käytetään ylimääräistä aluketta. On myös helppo löytää mRNA (transkription aloituskohta) -sekvenssin +1 emäs alukepidennysmenetelmällä. Näytteessä olevan mRNA: n määrä voidaan kvantifioida tällä menetelmällä, jos käytetään ylimääräistä aluketta. On myös helppo löytää mRNA (transkription aloituskohta) -sekvenssin +1 emäs alukepidennysmenetelmällä. Näytteessä olevan mRNA: n määrä voidaan kvantifioida tällä menetelmällä, jos käytetään ylimääräistä aluketta.
Kuva 02: Pohjapidennys
Mitä eroa on Nick Translationin ja Primer Extensionin välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Nick Translation vs Primer Extension |
|
Nick-käännös on prosessi, joka luo leimattuja DNA-koettimia erilaisille hybridisaatioreaktioille. | Alustepidennys on tekniikka, jota käytetään spesifisen RNA: n löytämiseen tai geeniekspression tutkimiseen. |
Käytetyt entsyymit | |
Käytetään DNaasi 1- ja DNA-polymeraasientsyymejä. | Käytetään käänteiskopioijaentsyymiä. |
Merkitys | |
Nick-käännös helpottaa spesifisen DNA-sekvenssin merkitsemistä. | Alustepidennys mahdollistaa spesifisen mRNA-sekvenssikoon ja näytteessä olevan määrän tunnistamisen. |
Yhteenveto - Nick Translation vs Primer Extension
Nick-käännös on menetelmä, jolla syntetisoidaan leimattuja koettimia, jotka perustuvat DNaasi 1- ja E coli-DNA-polymeraasi 1 -entsyymien aktiivisuuteen. Se on in vitro -menetelmä, jota käytetään laboratorioissa ennen erilaisia hybridisaatiotekniikoita. Lempinranslaation aikana DNA-polymeraasi 1: n 5'-3'-eksonukleaasiaktiivisuus poistaa nukleotidit ennen nikkeliä ja DNA-polymeraasi 1: n polymeraasiaktiivisuus korvaa poistetut nukleotidit leimattuilla nukleotideilla lempin takana. Alukepidennys on menetelmä, jota käytetään spesifisen RNA-transkription havaitsemiseksi seoksesta ja kvantifioimaan kiinnostavan RNA: n koko ja määrä. Tämä on ero nick-käännöksen ja alukkeen pidennyksen välillä.
Suositeltava:
Ero Siirtogeenisten Ja Koputtavien Hiirten Välillä
Tärkein ero siirtogeenisten hiirien ja tyrmäyshiirien välillä on, että siirtogeenisten hiirten genomiin on lisätty vieraita geenejä, kun taas knockout-hiirillä on func
Ero Nousevan Ja Laskevan Paperikromatografian Välillä
Keskeinen ero nousevan ja laskevan paperikromatografian välillä on se, että nouseva paperikromatografia käsittää liuottimen liikkeen
Ero DNA-RNA-hybridien Ja DsDNA: N Välillä
Keskeinen ero DNA-RNA-hybridien ja dsDNA: n välillä on, että DNA-RNA-hybridit ovat kaksisäikeisiä nukleotideja, jotka koostuvat yhdestä DNA-juosteesta ja yhdestä komplementista
Ero Vatsan Proteiinien Ruoansulatuksen Ja Pienen Suoliston Välillä
Tärkein ero proteiinin pilkkomiseen mahassa ja ohutsuolessa on, että proteiinin pilkkominen mahassa tapahtuu pepsiinin ja suolahapon avulla
Ero Anthronen Ja DNSA-menetelmän Välillä
Tärkein ero Anthrone- ja DNSA-menetelmien välillä on, että Anthrone-testi on yleinen testi kaikenlaisten hiilihydraattien havaitsemiseksi, kun taas DNSA-menetelmä on qua