Keskeinen ero funktionaalisen ryhmän ja substituentin välillä on se, että funktionaalinen ryhmä on molekyylin aktiivinen osa, kun taas substituentti on kemiallinen laji, joka voi korvata atomin tai atomiryhmän molekyylissä.
Termit funktionaalinen ryhmä ja substituentti löytyvät usein orgaanisesta kemiasta. Funktionaalinen ryhmä on tietyn tyyppinen substituentti, joka aiheuttaa molekyylin aktiivisuuden. Tämä tarkoittaa, että tietyn molekyylin läpi käyvät reaktiot määräytyy funktionaalisen ryhmän mukaan. Substituentti voi kuitenkin olla joko aktiivinen kemiallinen laji tai ei-aktiivinen kemiallinen laji.
