Tärkein ero mykoplasman ja klamydian välillä on se, että mykoplasma on bakteerisuku, josta puuttuu soluseinä, kun taas klamydia on bakteerisuku, joka sisältää gram-negatiivisia ja pakollisia loisia.
Mycoplasma-lajit ovat pienimpiä löydettyjä bakteereja, joilla on pienimmät genomit ja vähimmäismäärä erittäin välttämättömiä organelleja. Mycoplasma on seinämättömiä bakteereja. Siksi niillä ei ole tarkkaa muotoa. Yleensä ne ovat pallomaisia filamenttimuotoisiin soluihin. Sitä vastoin klamydia on bakteerien suku, jolla on soluseinät. Ne ovat gram-negatiivisia bakteereja. Sekä mykoplasma että klamydia aiheuttavat sukupuolitauteja. Lisäksi niillä on samanlaisia oireita, mutta niitä voidaan hoitaa erilaisilla antibiooteilla.
