Keskeinen ero genotoksisuuden ja mutageenisuuden välillä on, että genotoksisuus on aineen kyky aiheuttaa toksisuutta solun DNA: lle / geneettiselle materiaalille, kun taas mutageenisuus on aineen kyky aiheuttaa mutaatioita.
Genotoksisuus ja mutageenisuus ovat kaksi samanlaista termiä, joita ihmiset tulkitsevat usein väärin ja käyttävät keskenään. Genotoksisuus on kemikaalin tai aineen aiheuttama toksinen vaikutus solun geeneihin tai DNA: han. Siten kemikaali, jolla on genotoksinen vaikutus, on genotoksiini. Sitä vastoin mutageenisuus on aineen kyky aiheuttaa tai indusoida mutaatioita. Genotoksinen kemikaali ei välttämättä ole mutageeninen aine. Ne voivat olla mutageeneja. Kaikki mutageeniset aineet ovat kuitenkin genotoksisia, koska niillä on ominaisuus tuhota solun geneettinen materiaali.