Keskeinen ero antigeenin ja vasta-aineen välillä on, että antigeeni on mikä tahansa aine, joka saa immuunijärjestelmän tuottamaan vasta-aineita sitä vastaan, kun vasta-aine on Y-muotoinen immunoglobuliinia suojaava proteiini, joka kykenee sitoutumaan antigeeneihin neutraloidakseen ne.
Immunologian ydinkäsitys samoin kuin jotkut mikrobiologian, patologian ja dermatologian näkökohdat perustuvat antigeeni-vasta-ainereaktioiden peruskäsitteiden ymmärtämiseen. Nämä ovat rakennusosa suurille tietopohjoille ja uusille tekniikoille erilaisten sairauksien torjumiseksi.
