Keskeinen ero dyneiinin ja kinesiinin välillä on se, että dyneiini on sytoskeletoni-moottoriproteiini, joka liikkuu kohti mikrotubulusten miinuspäätä, kun taas kinesiini on toinen sytoskeletonimoottoriproteiini, joka liikkuu kohti mikrotubulusten pluspäätä.
Sytoskeleton koostuu erilaisista filamenteista. Mikrotubulukset ovat yksi niistä. Ne ohjaavat aineen liikkumista solun sisällä. Ne ovat tärkeitä myös solun muodon ylläpitämisessä. Sen lisäksi mikrotubulukset ovat elintärkeitä kromosomien erottamisessa mitoosissa ja meioosissa. Lisäksi mikrotubulukset ovat joidenkin eukaryoottisolujen silmien ja flagellien avainkomponentteja. Rakenteellisesti mikrotubulukset ovat polaarisia rakenteita. Heillä on plus ja miinus loppu. Yleensä miinuspää ulottuu kohti solun keskustaa, kun taas plus pää ulottuu kohti solun pintaa. Rakkuloiden ja organellien solunsisäisen kuljetuksen aikana kahden tyyppiset sytoskelettimoottoriproteiinit auttavat mikrotubuluksia. Ne ovat dyneiinejä ja kinesiinejä. Dyneiinit liikkuvat kohti mikrotubulusten miinuspäätä kuljettaessaan materiaaleja solun keskelle. Sitä vastoin kinesiinit kulkevat kohti solun pintaa kuljettaen materiaaleja solun kehälle.
