Keskeinen ero ektomykoriisien ja endomykoriisien välillä on se, että sienihifat eivät tunkeudu ektomykorisaasien kasvinjuurten kortikaalisiin soluihin, kun taas sienihifit tunkeutuvat endomykorrhisaiden kasvien juurien aivokuorisoluihin.
Mycorrhizae on tärkeä symbioottinen suhde, joka esiintyy sienten ja ylempien kasvien juurien välillä. Sekä sienet että kasvit saavat hyötyä tästä yhdistyksestä. Sienihifat tunkeutuvat maaperään ja tuovat ravinteita kasveihin, kun taas kasvit tarjoavat myös etuja sienille. Siksi se on ekologisesti tärkeä suhde. Mikä tärkeintä, sienihifat voivat kasvaa useita metrejä ja kuljettaa vettä ja ravinteita, erityisesti typpeä, fosforia, kaliumia juuriin. Lisäksi mycorrhizal-yhdistys suojaa kasvia juuripatogeeneiltä. Ravinteiden puutteen oireita esiintyy siis vähemmän todennäköisesti kasveissa, jotka ovat näissä symbioottisissa yhdistelmissä. On olemassa kahden tyyppisiä mykorritsoja: ektomykoriza ja endomykoriza.
