Keskeinen ero primaaristen ja sekundaaristen allyylikarbokationien välillä on, että primaarinen allyylikarbokationi on vähemmän vakaa kuin sekundaarinen allyylikarbokationi.
Allyylikarbokationi on resonanssistabiloitunut hiilirakenne. Se on ioni, joka sisältää positiivisen varauksen. Näissä ioneissa positiivinen ioni asetetaan allyylihiiliatomille (allyylihiiliatomi on kaksoissidoksen viereinen atomi). Primaarinen allyylikarbokatio on allyylikarbokationi, jossa positiivinen varaus sijoitetaan primaariseen hiiliatomiin, kun taas sekundaarinen allyylikarbokationi on allyylikarbokationi, jossa positiivinen varaus sijoitetaan sekundääriseen hiiliatomiin.
