Keskeinen ero prokaryoottisten ja eukaryoottisten ribosomien välillä on, että prokaryoottiset ribosomit ovat 70S-partikkeleita, jotka koostuvat 50S suuresta alayksiköstä ja 30S pienestä alayksiköstä, kun taas eukaryoottiset ribosomit ovat 80S-hiukkasia, jotka koostuvat 60S suuresta alayksiköstä ja 40S pienestä alayksiköstä.
Prokaryootit ja eukaryootit ovat kaksi pääryhmää eläviä organismeja, jotka eroavat solujärjestelmästä. Prokaryooteilla ei ole ydintä ja membraaniin sitoutuneita soluorganelleja. Toisaalta eukaryooteilla on ydin ja membraaniin sitoutuneet soluorganellit. Molemmille organismeille on joitain yhteisiä organelleja. Ribosomi on yksi tärkeistä ja elintärkeistä organelleista, joita esiintyy sekä prokaryoottisissa että eukaryoottisoluissa. Ne ovat läsnä kunkin solun sytoplasmassa. Rakenteellisesti proteiini ja ribosomaalinen RNA (rRNA) muodostavat yhdessä ribosomit. Ja ne koostuvat kahdesta alayksiköstä, nimittäin suuremmasta alayksiköstä ja pienestä alayksiköstä. Lisäksi he suorittavat saman tehtävän kuin mRNA-molekyylien käännös proteiineiksi. Koska translaatio on elintärkeä prosessi kaikille eläville organismeille ja sitä esiintyy ribosomeissa,ribosomit ovat erittäin tärkeitä sekä prokaryooteille että eukaryooteille. Huolimatta monista samankaltaisuuksista, prokaryoottisten ja eukaryoottisten ribosomien välillä on joitain eroja.