Keskeinen ero välittäjäaineiden ja hormonien välillä on se, että välittäjäaineet ovat kemiallisia lähettimiä, joita hermosto käyttää hermoimpulssin välittämiseen synapsien yli, kun taas hormonit ovat kemiallisia lähettimiä, joita hormonaalinen järjestelmä stimuloi tai kommunikoi tiettyjen kohdesolujen kanssa.
Hermosto ja hormonitoiminta ovat elimistössä erittäin tärkeitä elinjärjestelmiä, jotka säätelevät erilaisia toimintoja. Molemmat järjestelmät ovat riippuvaisia erityisten kemikaalien vapautumisesta joko hermovälittäjäaineina tai vastaavasti hormoneina. Nämä välittäjäaineet ja hormonit toimivat kemiallisina lähettiminä ja helpottavat hermoimpulssien siirtymistä ja fysiologisten toimintojen säätelyä kehossamme.