Keskeinen ero - genotyypin määrittäminen vs sekvensointi
Genotyypitys ja sekvensointi ovat kaksi tekniikkaa, jotka suoritetaan tiedon saamiseksi nukleiinihapoista, pääasiassa organismin DNA: sta. Keskeinen ero genotyypityksen ja sekvensoinnin välillä on se, että genotyypitys on prosessi sen määrittämiseksi, mikä geneettinen muunnos yksilöllä on markkereita käyttäen, kun taas sekvensointi on nukleotidisekvenssin oikean järjestyksen määrittäminen annetussa DNA-fragmentissa.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on genotyypitys
3. Mikä on sekvensointi
4. Rinnakkainen vertailu - genotyypitys vs sekvensointi
5. Yhteenveto
Mikä on genotyypitys?
Genotyypitys on yksilön geneettisen rakenteen määrittäminen käyttämällä DNA: n ja markkereiden sekvenssiä ja sen perinnön vertailu ja tunnistaminen. Genotyypitys on tärkeää evoluutiobiologiassa, populaatiobiologiassa, taksonomiassa, ekologiassa ja organismien genetiikassa. Se voidaan suorittaa erilaisilla tekniikoilla, mukaan lukien DNA-sekvensointi, polymeraasiketjureaktio, restriktiofragmentin pituuden polymorfismi (RFLP), satunnaistettu amplifioitu polymorfinen detektio, amplifioitu fragmentin pituuden polymorfismi (AFLP), DNA-mikrosäteet jne.
Genotyypitykseen sisältyy tiettyjen pienten DNA-sekvenssifragmenttien sekvensointi ja geneettisen koostumuksen sukulaisuuden löytäminen muiden yksilöiden kanssa geneettisten markkereiden avulla. Se määrittää yksittäisten nukleotidien polymorfismit (SNP) yksilöiden tai spesifisten alleelien joukossa. Genotyypitys on sovellettavissa monenlaisille organismeille, mukaan lukien ihmiset. Sitä voidaan soveltaa myös mikro-organismeihin, kuten viruksiin, sieniin jne., Ja sitä voidaan käyttää määrittämään niiden geneettiset variantit vertailuprofiilien avulla. Molekyyliepidemiologiassa ja oikeuslääketieteellisessä mikrobiologiassa taudinaiheuttajien, erityisesti mikro-organismien, hallinta tapahtuu genotyypistä saatujen tietojen avulla. Genotyypitys on erittäin tärkeää sukututkimusanalyysissä. Ihmisille tehdään genotyyppi äitiyden ja isyyden vahvistamiseksi. Genotyyppi paljastaa geenien hallitsevat ja resessiiviset alleelit, jotka päättävät tietyistä ominaisuuksista.
Kuva_1: RFLP-genotyypitys
Mikä on sekvensointi?
Sekvensointi on prosessi, jolla määritetään nukleotidin oikea järjestys tietyssä DNA- tai RNA-fragmentissa. Lähes kaikki organismin kasvuun ja kehitykseen tarvittavat tiedot on koodattu sen genomiin. Muutaman sadan nukleotidin pituisten nukleiinihappofragmenttien tuottamiseen ja erottamiseen liittyvien tekniikoiden saatavuus johti menetelmien kehittämiseen tietyn DNA- tai RNA-fragmentin tarkan nukleotidisekvenssin määrittämiseksi. Erilaisia sekvensointimenetelmiä on saatavilla tänään. Nämä sekvensointimenetelmät yhdessä koko organismin genomin edustavien genomikirjastojen rakentamistekniikoiden kanssa helpottavat kyseisen organismin koko genomin sekvensointia tekemällä perusteellisen analyysin geenirakenteista, geenitoiminnoista, geenien sijainnista, geeniekspressioista, geenien kartoitus, geenien säätelyalueet jne.
Monien virusten, useiden bakteerien, arkeebakteerien, hiivan ja useiden muiden organismien kokonaisgenomit on sekvensoitu ja kartoitettu. Ihmisen genomiprojekti on mahdollistanut koko ihmisen genomin sekvensoinnin ja kartoituksen sekä ensimmäisen luonnoksen julkaisemisen vuonna 2003. Se on merkittävä virstanpylväs biologian kehityksessä. Ihmisen genomisekvenssejä käytetään nyt lääketieteen alalla harvinaisten sairauksien geneettisten syiden tunnistamiseksi, vastasyntyneiden tautiriskin selvittämiseksi, erilaisten syöpien geneettisten yksityiskohtien tunnistamiseksi, uusien terapioiden kehittämiseksi ja uusien diagnostisten välineiden kehittämiseksi jne.
Kasvimaailmassa riisigenomi ja Arabidopsis-genomit on sekvensoitu. Näiden sekvenssien tuntemus mullistaa epäilemättä käsityksemme solujen ja organismien toiminnasta.
Kuva_2: Autoradiografia laulusekvensoinnista
Mitä eroa on genotyypillä ja sekvensoinnilla?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Genotyypitys vs sekvensointi |
|
| Genotyypitys on prosessi yksilön geneettisen koostumuksen määrittämiseksi ja kyseisen organismin ryhmän tai taksonomian tarkistamiseksi. | Sekvensointi on prosessi tietyn DNA- tai RNA-fragmentin nukleotidien tarkan järjestyksen määrittämiseksi. |
| Tekniikat | |
| RFLP, geenisekvensointi, PCR, DNA-mikrosäteet, AFLP jne. | Sanger-sekvensointi, Gilbert-sekvensointi, pyrosekvensointi, seuraavan sukupolven sekvensointi, haulikon sekvensointi jne. |
| Suurimmat huolenaiheet | |
| Tämä on enemmän huolissaan siitä, antavatko genotyyppierot todelliset fenotyyppierot. | Tämä on enemmän huolissaan nukleotidien järjestyksestä ja sen eroista ja muutoksista muiden organismien kanssa. |
Yhteenveto - genotyypin määrittäminen vs sekvensointi
Genotyypitys ja sekvensointi ovat hyödyllisiä organismien geneettisen tiedon tutkimiseen. Genotyypitys on prosessi, jolla määritetään yksilöiden väliset genotyyppivaihtelut ja löydetään heidän luokkansa. Sekvensointi on prosessi nukleotidien oikean järjestyksen määrittämiseksi kiinnostuneessa fragmentissa tai DNA-alueella. Molemmat tekniikat tarjoavat tärkeitä tietoja geeneistä ja genomeista.
