Peptidi vs. proteiini
Aminohapoille, peptideille ja proteiineille viitataan usein samankaltaisina termeinä, mutta niiden ominaisuudet eroavat toisistaan. Aminohapot ovat sekä peptidien että proteiinien rakennuspalikoita. Aminohappo on pieni molekyyli, joka sisältää aminoryhmän (-NH 2) ja karboksyylihapon (-COOH), joka on sidottu keskellä hiiliatomin, ja lisää vetyä ja sivuketjun (R-ryhmä). Tämä sivuketju vaihtelee kaikkien aminohappojen välillä; siten se määrittää kunkin aminohapon ainutlaatuiset merkit ja kemian. Erityistä geenisekvenssiä käytetään aminohapposekvenssin määrittämiseen sekä peptideissä että proteiineissa.
Peptidi
Peptidit koostuvat kahdesta tai useammasta aminohaposta, jotka on kytketty peptidisidoksilla ja joita on läsnä lineaarisina ketjuina. Peptidin pituus määräytyy siinä olevien aminohappojen määrän perusteella. Tavallisesti peptidin pituus on alle noin 100 aminohappoa.
Etuliitteitä käytetään kuvaamaan peptidityyppiä yleisessä terminologiassa. Esimerkiksi, kun peptidi on valmistettu kahdesta aminohaposta, sitä kutsutaan dipeptidiksi. Tällä tavoin kolme aminohappoa yhdistetään tripeptidien tuottamiseksi, neljä aminohappoa yhdistetään tetrapeptidien tuottamiseksi jne. Näiden tyyppien lisäksi on oligopeptidejä (koostuu 2-20 aminohaposta) ja polypeptidejä, joissa on paljon peptidejä (vähemmän yli 100). Peptidien tärkeimmät ominaispiirteet määräytyvät aminohappojen määrän ja sekvenssin perusteella.
Useimpien peptidien ensisijainen tehtävä on mahdollistaa tehokas viestintä kuljettamalla biokemiallisia viestejä kehosta paikasta toiseen.
Proteiini
Proteiinit ovat monipuolisin ryhmä biologisia makromolekyylejä. Proteiini koostuu yhdestä tai useammasta haaroittumattomasta ketjusta, joita kutsutaan polypeptideiksi, ja silti proteiinien rakennuspalikat ovat aminohappoja. Aminohapposekvenssi määrää proteiinin pääominaisuudet, kun taas tämä aminohapposekvenssi määritetään tietyllä geenisekvenssillä.
Yleensä proteiineilla on vakaat kolmiulotteiset rakenteet. Näistä rakenteista voidaan keskustella neljän tason hierarkiana; ensisijainen, toissijainen, tertiäärinen ja kvaternaarinen. Ensisijainen rakenne on proteiinin aminohapposekvenssi. Sekundaarirakenne syntyy muodostamalla vetysidoksia kahden lähellä olevan aminohapon välille, jolloin tuloksena ovat rakenteet, joita kutsutaan β-pinnoitetuiksi levyiksi, ja kelat, joita kutsutaan a-helekseiksi. Sekundaarirakenteen alueet taitetaan sitten edelleen avaruudessa proteiinin lopullisten kolmiulotteisten rakenteiden muodostamiseksi. Useiden polypeptidien sijoittuminen avaruuteen johtaa proteiinin kvaternaariseen rakenteeseen.
Proteiinien päätoiminnot ovat entsyymikatalyysi, puolustus, kuljetus, tuki, liike, säätely ja varastointi.
Mitä eroa on peptidillä ja proteiinilla?
• Peptidit ovat lyhyitä lineaarisia aminohappoketjuja, kun taas proteiinit ovat hyvin pitkiä aminohappoketjuja.
• Useat aminohapot kytketään yhteen muodostaen peptidi peptidisidoksilla, kun taas useat peptidit liitetään yhteen muodostaen proteiinimolekyylejä.
• Normaalisti proteiineilla on vakaa kolmiulotteinen rakenne. Sitä vastoin peptidit eivät ole organisoituneet stabiiliin kolmiulotteiseen rakenteeseen.
• Peptidin pituus on alle noin 100 aminohappoa, kun taas proteiinin pituus on yli 100 aminohappoa. (On olemassa poikkeuksia; siis erot riippuvat enemmän molekyylien toiminnasta kuin niiden koosta)
• Toisin kuin peptidit, proteiineja pidetään makromolekyyleinä.
• Peptideissä vain aminohappojen sivuketjut muodostavat vetysidoksia. Proteiineissa paitsi sivuketjut myös peptidiryhmät muodostavat vetysidoksia. Nämä vetysidokset voivat olla veden tai muiden peptidiryhmien kanssa.
• Kaikki peptidit ovat lineaarisia ketjuja, kun taas proteiinit voivat olla primaarisia, sekundaarisia, tertiäärisiä ja kvaternaarisia.
