Keskeinen ero NMR: n ja röntgenkristallografian välillä on, että NMR on analyyttinen tekniikka, jota käytetään orgaanisen molekyylin atomien tyypin ja lukumäärän määrittämiseen, kun taas röntgenkristallografia on analyyttinen tekniikka, jota käytetään kiteen atomi- ja molekyylirakenteen määrittämiseen.
Termi NMR tarkoittaa ydinmagneettista resonanssia. Tämä termi kuuluu analyyttisen kemian osa-aihespektroskopiaan. Röntgenkristallografia on puolestaan eräänlainen kristallografiatekniikka, jossa käytämme röntgensädettä kiteiden analysointiin.