Tärkein ero genokopian ja fenokopian välillä on, että genokopioissa fenotyypit osoittavat samankaltaisuutta ja genotyyppi muuttuu, kun taas fenokopioissa fenotyypit vaihtelevat ja genotyyppi pysyy muuttumattomana.
Genokopian ja fenokopian välinen ero liittyy selittämään genetiikan harvinaisia esiintymiä. Nämä kaksi käsitettä osoittavat, kuinka perinteinen genetiikka tai Mendelin genetiikka voi vaihdella luonnossa olevien poikkeusten perusteella. Genokoopilla tarkoitetaan ilmiötä, joka antaa samanlaisen fenotyypin huolimatta siitä, että sillä on erilainen genotyyppi. Sitä vastoin fenokopia viittaa ilmiöön, jossa fenotyypit vaihtelevat huolimatta siitä, että genotyyppi pysyy muuttumattomana.
