Keskeinen ero happohydrolyysin ja entsymaattisen hydrolyysin välillä on se, että happohydrolyysi on kemiallinen prosessi, kun taas entsymaattinen hydrolyysi on biokemiallinen prosessi.
Hydrolyysi viittaa kemiallisten sidosten pilkkomiseen lisäämällä vesimolekyyliä. Se voi tapahtua kahdella tavalla: kemiallisilla tai biologisilla keinoilla. Kun se tapahtuu kemiallisesti, kutsumme sitä happohydrolyysiksi ja sidoksen pilkkoutumisen syy on kemiallinen laji (happo). Hydrolyysiä biologisilla keinoilla kutsutaan kuitenkin entsymaattiseksi hydrolyysiksi, koska sidoksen pilkkominen tapahtuu tässä prosessissa entsyymien läsnä ollessa.
