Keskeinen ero anammoksin ja denitrifikaation välillä on se, että anammoksilla tarkoitetaan anaerobista ammoniumhapetusta, joka muuttaa ammoniumin ja nitriitit typpikaasuksi anoksisissa olosuhteissa. Samaan aikaan, kun denitrifikaatio on biologisia muutoksia nitraatin N: ksi 2 mukaan denitrifioivien bakteerit.
Typen kierto on tärkeä biogeokemiallinen kierto, jossa typpi on muunnettu eri kemiallisissa muodoissa, kuten NH 3, NH 4 +, NO 2 -, NO 3 -Typpisyklissä on neljä suurta prosessia. Ne ovat kiinnitys, ammonifikaatio, nitrifikaatio ja denitrifikaatio. Monet näistä prosesseista suoritetaan mikro-organismeilla, erityisesti maaperässä olevilla bakteereilla. Anammox on yksi uusimmista typpisyklin lisäyksistä. Se on anaerobisen ammoniumhapetuksen prosessi. Tietty bakteeriryhmä, joka tunnetaan nimellä planctomycetes, suorittaa tämän prosessin. Heillä on erityinen organelli, jota kutsutaan anammoksosomeiksi, jotka tarjoavat paikan anammoksireaktiolle. Loppujen lopuksi sekä denitrifikaatio että anammox tuottavat typpikaasua.
