Keskeinen ero primaarisen ja sekundaarisen kineettisen isotooppivaikutuksen välillä on se, että primaarinen isotooppivaikutus kuvaa isotooppisubstituutiota rikkoutuneessa sidoksessa, kun taas sekundaarinen isotooppivaikutus kuvaa isotooppisubstituutiota rikkoutuneen sidoksen vieressä olevassa sidoksessa.
Kineettinen isotooppivaikutus tai KIE viittaa kemiallisen reaktion reaktionopeuden muutokseen isotoopin korvaamisen yhteydessä. Tässä reaktantissa oleva atomi korvataan sen isotoopilla, joten reaktionopeus eroaisi alkuperäisestä nopeudesta. Sitten voimme määrittää KIE-arvon jakamalla kevyen isotooppisesti substituoidun reagenssin sisältävän reaktion nopeusvakion reaktion nopeusvakiosta, johon liittyy raskas isotooppisesti substituoitu reaktantti. Siksi yli 1: n KIE: tä pidetään normaalina kineettisenä isotooppivaikutuksena, kun taas alle 1: n KIE: tä pidetään käänteisenä kineettisenä isotooppivaikutuksena.