Tärkein ero flagellan ja silmän välillä on, että lippu on pitkä ja sitä esiintyy yhdestä kahdeksaan solua kohden, kun taas silmät ovat lyhyitä ja satoja solua kohden.
Cilia ja Flagella ovat pieniä rakenteita, jotka on kiinnitetty eukaryoottisiin ja prokaryoottisiin soluihin. Ne ulkonevat solujensa pinnalta. Nämä rakenteet auttavat yksisoluisten organismien liikkumisessa. Niinpä ne sisältävät pääasiassa proteiineja, joita kutsutaan mikrotubuleiksi tai tyvirungoksi. Yksisoluisten eukaryoottisten organismien tapauksessa sekä ripset että liput ovat elintärkeitä liikkumiselle. Toisaalta, monisoluisissa organismeissa, ripset ja liput auttavat nesteiden ja muiden materiaalien liikkumisessa kehon putkia pitkin samalla, kun ne suorittavat solun tai soluryhmän siirtämisen. Flagellan ja silian välillä on kuitenkin jonkin verran eroa; erityisesti ne eroavat toisistaan niiden solujen pituuden, koon, ulkonäön ja tyypin suhteen, joihin ne on kiinnitetty.
