Tärkein ero klorofyllin A ja B välillä on se, että klorofylli A on ensisijainen fotosynteettinen pigmentti kasveissa ja levissä, kun taas klorofylli B on lisäpigmentti, joka kerää energiaa ja siirtyy klorofylli A.
Klorofylli on kasveissa ja levissä olevien luonnollisten pigmenttien perhe, joka on vastuussa niiden vihreästä väristä. Klorofylli absorboi auringonvalon energiaa ja hyödyntää tätä energiaa hiilihydraattien syntetisoimiseksi vedestä ja hiilidioksidista. Fotosynteesiksi kutsuttu prosessi ylläpitää elämänprosesseja kaikissa kasveissa, kun niiden energiavaatimukset täyttyvät tämän prosessin kautta. Lisäksi fotosynteesi on tärkein prosessi, joka ylläpitää kaikkia eläviä organismeja, koska kasvit ovat kaikkien ravintoketjujen alkutuottajia. Eläimet ja ihmiset kuluttavat kasvien tuotteita. Klorofyllipigmenttiperheessä on useita klorofyllipigmenttejä. Niistä klorofylli A ja klorofylli B ovat kahden tyyppisiä klorofyllejä. Niillä on samanlainen rakenne, porfyriinirenkaassa on pieni ero. Klorofylli A: lla on CH3 ryhmää porfyriinirenkaassa, kun taas klorofylli B: llä on CHO (aldehydiryhmä) porfyriinirenkaassa.
