Keskeinen ero komposiitti- ja ei-komposiittitransposonien välillä on se, että komposiittitransposoneilla on kaksi vierekkäistä insertiosekvenssiä, kun taas muilla kuin komposiittitransposoneilla on käänteiset toistot vierekkäisten insertiosekvenssien sijaan.
Transposoni on DNA-fragmentti, joka voi siirtyä bakteerigenomiin. Ne ovat liikkuvia DNA-sekvenssejä. He muuttavat genomin uusiin paikkoihin. Nämä liikkeet tekevät muutoksia bakteerigenomin sekvenssissä aiheuttaen merkittäviä muutoksia geenitiedoissa. Ne ovat siirrettäviä geneettisiä elementtejä, jotka ovat vastuussa uusien geneettisten sekvenssien luomisesta bakteereihin. Transposoneja kutsutaan myös hyppäviksi geeneiksi, koska nämä hyppysekvenssit voivat estää geenien transkription ja järjestää uudelleen bakteerin geneettisen materiaalin. Lisäksi he ovat vastuussa lääkeresistenssin, antibioottiresistenssigeenien liikkumisesta plasmidien ja kromosomien välillä. Transposoneja on kahden tyyppisiä komposiitti- ja ei-komposiitti-transposoneja.