Tärkein ero silmä-stereosilian ja mikrovillien välillä on se, että silmät ovat pieniä hiustyyppisiä rakenteita, jotka koostuvat mikrotubuleista, kun taas stereokilia on nippu hiusmuotoisia ulkonemia, jotka koostuvat aktiinifilamenteista, ja mikrovillit ovat aktiinifilamenteista koostuvia solukalvojen taitoksia.
Silmät, stereosilia ja mikrovillit voivat näyttää samanlaisilta rakenteilta, kun niitä havaitaan ulkopuolelta. Mutta ne ovat rakenteellisesti ja toiminnallisesti erilaisia toisistaan. Ne ovat hiusten kaltaisia rakenteita, jotka ovat mikroskooppisia. Lisäksi ne ovat proteiinikuituja, jotka ulottuvat soluista ulospäin.