Tärkein ero anastomoosin ja fistelin välillä on se, että anastomoosi viittaa kahden putkimaisen rakenteen, kuten verisuonten, kahden suolen silmukan jne. Väliseen yhteyteen, kun taas fisteli on epänormaali yhteys kahden onton tilan, kuten verisuonten, suoliston tai muun onton, välillä elimet.
Anastomoosi on yhteys verisuonten tai kahden suolen silmukan välillä. Normaalisti se yhdistää kaksi kaukana olevaa tai erillistä osaa. Lisäksi se voi olla kirurginen yhteys kahden putkimaisen rakenteen välillä. Anastomoosi voi yhdistää kaksi terveellistä rakennetta. Se voi myös olla epänormaali tila, jota kutsutaan fistulaksi.