Keskeinen ero CRISPR: n ja restriktioentsyymien välillä on, että CRISPR on luonnossa esiintyvä prokaryoottinen immuunipuolustusmekanismi, jota on äskettäin käytetty eukaryoottisten geenien muokkaamiseen ja muokkaamiseen, kun taas restriktioentsyymit ovat biologisia saksia, jotka pilkkovat DNA-molekyylit pienempiin aineisiin.
Genomin muokkaus ja geenimodifikaatio ovat mielenkiintoisia ja innovatiivisia aloja genetiikassa ja molekyylibiologiassa. Geeniterapiatutkimuksissa käytetään laajasti geenimodifikaatiota. Lisäksi geenimodifikaatio on hyödyllinen tunnistettaessa geenin ominaisuudet, geenin toimivuus ja miten geenimutaatiot voivat vaikuttaa sen toimintaan. On tärkeää saada tehokkaita ja luotettavia tapoja tehdä tarkkoja, kohdennettuja muutoksia elävien solujen genomiin. CRISPR ja restriktioentsyymit ovat avainasemassa geenimodifikaatioissa. CRISPR muokkaa geenejä erittäin tarkasti. Rajoitusentsyymit toimivat biologisina saksina, jotka pilkkovat DNA-molekyylit pienemmiksi aineiksi.