Tärkein ero omenahapon ja maleiinihapon välillä on, että omenahappo on tyydyttynyt dikarboksyylihappo, kun taas maleiinihappo on tyydyttymätön dikarboksyylihappo.
Omenahappo ja maleiinihappo ovat dikarboksyylihappoja. Tämä tarkoittaa, että nämä yhdisteet sisältävät kaksi karboksyyliryhmää (-COOH) samassa molekyylissä, kiinnittyneenä kahteen eri hiiliatomiin. Omenahapon ja maleiinihapon välinen ero on kyllästymisessä (kaksois- tai kolmoissidosten läsnäolo tarkoittaa tyydyttymättömyyttä). Koska maleiinihapolla on kaksoissidos kahden hiiliatomin välillä, se on tyydyttymätön yhdiste. Mutta omenahapon hiiliatomien välillä ei ole kaksois- tai kolmoissidoksia.
