Tärkein ero välillä risteytyksiä ja lajinsisäiset hybridisaatio on, että lajien välinen hybridisaatio tapahtuu kahden sukua olevilla yksilöillä, jotka kuuluvat kahteen eri lajeja, kun taas lajin sisäinen hybridisaatio tapahtuu välillä geneettisesti erilaisten kahden yksilön saman lajin.
Hybridisaatio on prosessi geneettisesti erilaistuneiden yksilöiden tai ryhmien parittamiseksi tai ylittämiseksi. Hybridisaation päätavoitteena on yhdistää eri organismeissa esiintyvät toivottavat geenit. Lisäksi hybridisaatiota käytetään puhdasjalostettujen jälkeläisten tuottamiseen. Parittelu voidaan tehdä kahden saman lajin tai kahden eri lajin yksilön välillä. Tämän perusteella on kahdenlaisia hybridisaatioita: intraspesifinen hybridisaatio ja interspecifinen hybridisaatio.
