Tärkein ero pepsiinin ja reniinin välillä on se, että pepsiini, joka on yksi tärkeimmistä ruoansulatusentsyymeistä, on mahalaukun erittämä proteaasi, kun taas reniini on entsyymi ja myös hormoni, jonka tuottavat munuaisen juxtaglomerulaariset solut.
Proteaasit ovat entsyymejä, jotka hydrolysoivat peptidisidoksia ja hajottavat proteiinit peptideiksi tai aminohapoiksi. Pepsiini on mahalaukun mehussa oleva proteaasi. Se on yksi tärkeimmistä ruoansulatusentsyymeistä, joka hajottaa proteiinipitoiset elintarvikkeet peptideiksi ja aminohapoiksi. Sitä vastoin reniini on entsyymi ja asparagiiniproteaasi. Se on reniini-angiotensiinijärjestelmän alkuentsyymi. Reniini toimii hormonina ja auttaa hallitsemaan verenpainetta.