Tärkein ero allelopatian ja antibioosin välillä perustuu kunkin ilmiön aikaansaamaan vaikutuksen tyyppiin. Allelopatia aiheuttaa sekä positiivisia että negatiivisia vaikutuksia kahden tai useamman organismin väliseen suhteeseen, kun taas antibioosi aiheuttaa kielteisiä vaikutuksia yhteen suhteessa mukana olevista organismeista.
Ravitsemuksella on tärkeä rooli organismien selviytymisessä. Tässä yhteydessä organismien välinen suhde ravintotarpeeseen on elintärkeää. Sekä allelopatia että antibioosi ovat suhteita, jotka tapahtuvat kahden tai useamman organismin välillä. He kuitenkin vastaavat toisiinsa eri muodoissa.