Keskeinen ero taksonomian ja systemaattisuuden välillä on, että taksonomia on kurinalaisuus luokitella organismit taksoneihin järjestämällä ne hyvin järjestetyllä tavalla, kun taas systemaattisuus on laaja biologian ala, joka tutkii lajien monipuolistumista.
Taksonomia ja systemaattisuus liittyvät hyvin läheisesti toisiinsa biologian aloilla. Taksonomiassa ja systemaattisuudessa on kuitenkin mielenkiintoisia eroja. Näiden kahden hyvin läheisen samankaltaisuuden vuoksi monet meistä odottavat näiden olevan samanlaisia. Siksi on tarpeen tutkia näitä kahta tieteenalaa tarkasti taksonomian ja systemaattisen todellisen eron ymmärtämiseksi, koska monet meistä, biologit mukaan lukien, saattavat olla jonkin verran hämmennystä.