Keskeinen ero nukleotidin ja nukleosidin välillä on se, että nukleotidi sisältää fosfaattiryhmän, kun taas nukleosidista puuttuu fosfaattiryhmä.
Nukleosidit ja nukleotidit ovat saman tyyppisiä molekyylejä, jotka eroavat toisistaan pienellä rakenteellisella muutoksella. Sekä nukleotidi että nukleosidit koostuvat kahdesta samasta komponentista; pentoosisokeri ja typpipitoinen emäs. Lisäksi nukleotidilla on yksi tai useampi fosfaattiryhmä. Täten, lisäämällä fosfaattiryhmä, nukleosidi voidaan muuntaa nukleotidiksi kinaasiksi kutsuttujen entsyymien avulla. Nukleotidi on nukleiinihappojen rakennuspalikka. Toisaalta nukleosidit ovat hyviä syöpää ja viruslääkkeitä.
