Tärkein ero atomihapen ja molekyylihapen välillä on se, että atomihappi on erittäin reaktiivinen eikä sitä ole ilmakehässä sellaisenaan, kun taas molekyylihappi on vähemmän reaktiivinen ja sitä esiintyy ilmakehässä sellaisenaan. Lisäksi atomi happi on vapaa radikaali, jolla on symboli O (3P), kun taas molekyylistä happea on kaksiatominen happi, jonka symboli O 2.
Happi on kemiallinen alkuaine, jolla on atominumero 8. Mutta kun viitataan yleisessä käytössä olevaan happeen, puhumme molekyylihapesta, jota hengitämme. Siinä on kaksi happiatomia, jotka ovat sitoutuneet toisiinsa kovalenttisen sidoksen kautta. Atomihapessa on yksi happiatomi. Siksi sitä ei voi esiintyä yksittäisenä kemiallisena lajina sen korkean reaktiivisuuden vuoksi.
