Keskimääräinen ero fluorivetyhapon ja kloorivetyhapon välillä on se, että fluorivetyhappo on heikko happo, kun taas suolahappo on vahva happo. Fluorivetyhappo pystyy myös muodostamaan vetysidoksia, kun taas kloorivetyhappo ei kykene muodostamaan vetysidoksia.
Lisäksi yksi tärkeä ero fluorivetyhapon ja kloorivetyhapon välillä on niiden molekyylirakenteessa. Fluorivetyhappomolekyylissä on fluori-ioni, kun taas suolahappomolekyylissä on kloridi-ioni. Lisäksi sekä fluorivetyhappo että kloorivetyhappo ovat protonien luovuttajia. Siksi nämä happomolekyylit voivat ionisoida vesipitoisissa väliaineissa vapauttaen protoneja (H +). Nämä protonit aiheuttavat happamuuden vesipitoisessa väliaineessa.
