Keskeinen ero histopatologian ja sytologian välillä on, että histopatologia on sairastuneiden kudosten tutkimus mikroskoopilla, kun taas sytologia on kehon yksittäisten solujen tutkimus.
Solut ovat elämän perusrakenteita. Lääketieteellisten sairauksien diagnosoinnin aikana patologit tutkivat solut ja kokonaiset kudokset. Kudosten tutkimus taudin suhteen tunnetaan histopatologiana. Sen sijaan yhden solutyypin tutkimus tunnetaan sytologiana. Siksi histopatologia tarkastelee kudoksia, kun taas sytologia tarkastelee yksittäisiä soluja.