Keskeinen ero acidofiilisten ja basofiilisten välillä on se, että solun acidofiiliset komponentit ovat happoa rakastavia ja happamia väriaineita käytetään niiden värjäämiseen, kun taas solun basofiiliset komponentit ovat emästä rakastavia ja emäksisiä väriaineita käytetään niiden värjäämiseen.
Värjäys on tekniikka, jota käytetään solujen ja niiden komponenttien visualisointiin, koska monet solut ovat värittömiä ja läpinäkyviä. Jotkut solun komponentit rakastavat happoa, kun taas jotkut osat ovat emästä rakastavia. Happamat värit ja emäksiset värit ovat kahden tyyppisiä väriaineita, joita käytetään usein lausuntomenettelyissä. Basofiilisessä värjäyksessä käytetään emäksisiä väriaineita, kun taas happofilmeissä käytetään happamia väriaineita. Siksi asidofiiliset tai happoa rakastavat komponentit sitoutuvat happamiin väriaineisiin, kun taas basofiiliset tai emästä rakastavat komponentit sitoutuvat emäksisiin väriaineisiin.