Keskeinen ero sonikoinnin ja homogenisoinnin välillä on se, että sonikaatio on solujen hajotustekniikka, joka käyttää äänienergiaa kudosten ja solujen hajottamiseen, kun taas homogenisaatio on solujen hajotustekniikka, joka käyttää pääasiassa fyysistä voimaa solukalvojen rikkomiseen.
Biomolekyylien, niiden reaktioiden ja muun solusisällön analysoimiseksi tarvitaan kudosten hajottamista solujen vapauttamiseksi ja solujen vapauttamista niiden sisällön vapauttamiseksi. Solujen hajoamistekniikoita on erilaisia. Sonikaatio ja homogenointi ovat kaksi tällaista tekniikkaa. Sonikaatio käyttää äänienergiaa tai ultraääniaaltoja solujen hajottamiseen, kun taas homogenisaatio käyttää mekaanista voimaa solujen hajottamiseen.