Keskeinen ero RQ: n ja RER: n välillä on se, että RQ on suora mittaus verestä ja RER epäsuorassa mittauksessa hengityksen kautta.
Kalorimetria mittaa aineenvaihdunnasta tai energiankulutuksesta vapautuvan lämmön määrää. Aineenvaihdunta tarvitsee happea, ja se tuottaa hiilidioksidia. Hengityselinten osamäärä (RQ) ja Hengitysvaihtosuhde (RER) ovat kaksi samanlaista kalorimetriamittausta. RQ on kuitenkin suora mittaus verestä. Se on metabolinen vaihto kaasun suhde, joka on yhtä suuri kuin CO 2 tuotannon yli hapenottokykyä (CO 2 / O 2). RER on epäsuora mittaus hengityksen kautta. Siksi RQ on invasiivinen menetelmä, kun taas RER on ei-invasiivinen menetelmä.